Các biểu hiện của bệnh bao gồm: Xuất hiện mụn cóc, hạt cơm, u nhú hoặc các tổn thương phẳng, mềm, màu hồng nhạt, có chân hoặc cuống, không đau, dễ chảy máu và khu trú ở bất kỳ vị trí nào trong các cơ quan sinh dục như dương vật, âm hộ, lỗ niệu đạo, cổ tử cung, hậu môn..., và cả ở miệng, họng. Nếu không được điều trị kịp thời, các tổn thương trên da do bệnh gây ra sẽ phát triển nhanh chóng, lan rộng ra các vùng xung quanh, hình thành mảng, cục lớn.
Sùi mào gà rất nguy hiểm vì virus HPV có thể làm thay đổi cấu trúc của tế bào bị nhiễm bệnh, dẫn đến các biến chứng khác như ung thư cổ tử cung, âm hộ, dương vật, hậu môn, miệng, họng hay các vấn đề khi mang thai vì nếu người mẹ bị nhiễm bệnh thì có khả năng cao lây nhiễm sang con trong quá trình sinh nở, trẻ có khả năng sẽ bị nổi các nốt sùi mào gà trong miệng.